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Cytek 40色文章发表，详细方案及数据公布！
684 人阅读发布时间：2020-09-17 11:50
随着临床应用及科学研究的不断深入，研究者们希望在单个样本或同一时间点中获取的信息越来越多，但往往由于样本限制，开展多种类型的检测比较困难。Cytek 光谱流式技术的出现，使这些更为深入的科学研究成为可能。以40色方案为例，方案不仅包括识别特定细胞亚群的标记，如CD4 T细胞，CD8 T细胞、调节性T细胞、NK细胞、NK细胞、单核细胞和树突状细胞，还纳入了进一步细分的标记，如激活、分化及趋化因子受体标记。（图1）
图1-Cytek 40色深度免疫表型方案
40色方案的手动设门逻辑如下图所示，按图中箭头所示，在去除黏连体和死细胞后，根据不同免疫标记表达情况，依次圈出嗜碱性细胞，单核细胞，淋巴细胞，TCR γδ+T细胞，TCR γδ-T细胞，NKT细胞，NK细胞，Treg细胞，B细胞，树突细胞，ILCs细胞等约16个主要的细胞亚群。详细的手动设门方法可参考下面的逻辑关系图（图2）。
图2-Cytek 40色方案的手动设门逻辑
为了显示手动与自动分析的一致性，我们用来自四个供者的PBMCs样本进行高维数据分析，FlowSOM集群展示在两个UMAP维度上。重叠图为四个样本数据串联后的所有事件，图的密度表示各个样本在细胞群体分布上的差异。正如预期，这样一个高分辨率和高维数据的的组合，不可避免存在少数逃逸规范定义的细胞群体，这些群体被显示为灰色。（图3）
图3-高维数据聚类分析结果示意图
图4-高维数据降维分析结果示意图
所有的结果证实，
Cytek 40色方案是一个强大的研究工具，它几乎覆盖了人类外周免疫系统中的全部细胞组成，可用于深入分析用于深入研究人类外周血中的淋巴细胞、单核细胞和树突状细胞等细胞群体。Cytek 40色方案展示出了优秀的细胞群体分辨率，对于那些可用样本有限、或寻找独特的生物标志物的研究尤其有用。它也是基于光谱流式细胞术，发布的第一个OMIP方案。