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323 人阅读发布时间:2024-12-17 10:40
Cytek 45色文章正式见刊
近期,Cytek高维流式方案的又一力作--45色深度免疫分型方案在Cytometry Part A杂志上正式发表,这是Cytek作为全光谱流式高质量数据引领者的又一里程碑事件。

图1 – Cytek®全光谱流式细胞仪45色文章见刊1
高维流式方案中,相对于Broad panel而言,更具有挑战性的是Deep panel,即需要针对某群细胞进行精细化分型。这篇45色文章就是如此,在全景式描绘人外周血单个核细胞免疫图谱的同时,进一步深入挖掘了记忆T细胞的免疫表型。除此之外,高维方案在不同平台之间的结果重现,也是流式细胞仪中的另一个难度系数很高的挑战。这篇45色文章不仅在不同的全光谱流式分析平台间进行高维方案平移,还在全光谱分析分选双平台间也实现了高质量数据的重现,并且成功地完成了稀有细胞的6路分选实验。
Cytek高维方案里程碑事件回顾
2020年,流式方法学权威杂志Cytometry Part A中的OMIP(Optimized Multicolor Immunofluorescence Panels)系列,发表了第一篇全光谱流式细胞仪超多色文章--OMIP-0692,40色全光谱流式高维免疫分析方案,这是全光谱流式领域上具有里程碑式意义的成果。2022年,这篇文章荣获Cytometry Part A年度最佳文章奖,奠定了这篇文章作为高质量数据典型代表的公认地位。2024年,45色文章的问世,在全光谱分析和分选流式双平台实现高维方案平移复刻,更是开拓了全光谱流式应用更加多元化的角度和思路。

图2 - 2020年OMIP-069里程碑式意义的40色文章见刊3
在追求卓越的路上永不止步
截至目前,OMIP系列中全光谱流式细胞仪发表的文献量,Cytek当之无愧地稳居首位。Cytek发表的OMIP系列文章的研究对象囊括了人PBMC精细免疫分型、人单核细胞、人γδT细胞细致分群、人血小板综合表型分析、小鼠先天性和获得性淋巴细胞、小鼠代谢相关表型检测,以及猪-狒狒这类相对少见的种属。设计的实验方案从3激光16色到5激光45色,从分析到分选的应用均囊括其中。

图3 - Cytek®全光谱流式细胞仪在OMIP上发表的文章示例2,4
除OMIP文章外,还有许多利用Cytek全光谱流式系统在各个领域的多色应用方案发表在不同的杂志期刊,感兴趣的用户可访问Cytek微信公众号菜单栏-技术分享,获取更多信息。
45色全光谱流式方案搭配
基于OMIP-069的经典40色方案,作者保留了原方案37个指标,优化了其中部分荧光素,并且加入了8个新的指标。45色方案精细描绘了人外周血免疫细胞的全景式图谱,横向评估了T、B、NK、γδT、NKT、单核、嗜碱性粒、先天淋巴样(ILCs)、树突状(DCs)等细胞,纵向剖析了CD4+ 和CD8+ T细胞活化、耗竭、记忆和分化等指标,重点聚焦于记忆T细胞的深入分析。采用Cytek® Cloud 平台进行方案搭配,简化了高维方案的配色流程。值得一提的是,Cytek® Cloud平台中内置了已发表的所有OMIP方案,可以一键检索并作为方案设计的起点,同时,全新的AI智能化配色功能,让用户在短短几分钟时间内就能全自动生成高维流式方案。

图4 – 45色全光谱流式方案信息表
45色全光谱流式方案门控策略
1 如图5A所示,排除黏连体和红细胞后,圈选活的CD45+细胞,基于FSC/SSC区分淋巴/DCs/NK(SSC low)和单核(SSC high)细胞群;
2 非经典、中间、经典单核细胞:基于CD14/CD16圈选;
3 淋巴/DCs/NK细胞中,
1)B细胞:CD3-TCRγδ-CD19+CD20+,其中的Naïve、浆母细胞与IgD-记忆B细胞:以IgD/CD27/CD20进行区分;
2)DCs细胞:CD14-CD3-CD19-CD20-CD56-HLA-DR+,进一步细分为CD123+ pDCs和CD11c+ DCs;
3)NK细胞:CD14-CD3-CD19-CD20-HLA-DR-,根据CD56/CD16的表达丰度可分为早期、成熟与终端NK细胞;
4)CD123+的嗜碱性粒细胞与CD123-的ILCs:CD14-CD3-CD19-CD20-HLA-DR-CD56-CD16;
5)NKT样细胞:CD3+TCRγδ-CD56+;
6)T细胞:CD3+CD56-,分为CD4+、CD8+、CD4-CD8-三群;
4 CD4+ T 细胞:细分为Naïve、TSCM、TCM、早期类TEM、早期TEM、中期TEM、晚期TEM、TEMRA各类亚群,并平行对比各自功能性指标的表达(图5B)。

图5 – 45色方案手动圈门精细表征人PBMCs
全光谱分析分选双平台重现高质量数据
Cytek® Aurora™分析型流式细胞仪和Aurora™ CS分选型流式细胞仪均搭载专利的全光谱分析(Full Spectrum Profiling™, FSP™)技术,高维方案可以在双平台间“复制粘贴”,以高度一致的分辨率呈现高质量的结果。这是目前第一篇也是一一篇来自同一厂家的全光谱分析分选不同流式平台间,实现高维方案无缝衔接的文章。同一样品在3台Aurora™分析型流式细胞仪和1台Aurora™ CS分选型流式细胞仪上平行获取,从降维可视化分析结果来看,4台仪器呈现的结果完美的重叠,为实现多中心标准化打造了一体化的平台,也大大简化了分选实验的操作流程。

图6 – 全光谱流式分析和分选平台无缝衔接呈现高质量数据
进一步,作者采用Aurora™ CS全光谱分选型流式细胞仪,对于不同分化状态的CD4+ 记忆T细胞亚群同时进行6路分选,分选后的细胞经过培养,功能性维持很好,呈现出6种细胞不同的细胞因子表达趋势,说明6种细胞可能在免疫系统中“各司其职”,扮演着不同的角色。

图7 – 6路分选细胞并进行功能性验证
全光谱流式“C位”
Cytek Biosciences致力于打造高质量数据的标杆,在全光谱流式领域发表的文献量稳居首位,成为当之无愧的全光谱流式“C位”。Cytek不仅在高维多参数流式领域上深受权威杂志的高度认可,在其他的流式应用领域(包括经典和新兴领域)也是全面开花,成果众多,持续引领着全光谱流式细胞术迈向璀璨新纪元。
更多精彩分享,欢迎大家下载阅读文章的正文和补充材料,同时,也可以观看来自原文作者,Cytek Biosciences公司的副总裁,全光谱流式领域的资深专家Maria C. Jaimes的精彩讲座:“The Balancing Act Between Number Of Colors And Data Quality: Lessons Learned From Human Memory T Cells”,带来45色高质量文章的详细解读。
参考文献
1Park, L. M., Lannigan, J., Low, Q., Jaimes, M. C. & Bonilla, D. L. OMIP-109: 45-color full spectrum flow cytometry panel for deep immunophenotyping of the major lineages present in human peripheral blood mononuclear cells with emphasis on the T cell memory compartment. Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology, doi:10.1002/cyto.a.24900 (2024).
2Park, L. M., Lannigan, J. & Jaimes, M. C. OMIP-069: Forty-Color Full Spectrum Flow Cytometry Panel for Deep Immunophenotyping of Major Cell Subsets in Human Peripheral Blood. Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology 97, 1044-1051, doi:10.1002/cyto.a.24213 (2020).
3Mahnke, Y. & Tárnok, A. Celebrating 10 Years of OMIPs. Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology 97, 1017-1018, doi:10.1002/cyto.a.24232 (2020).
4Kare, A. J. et al. OMIP-095: 40-Color spectral flow cytometry delineates all major leukocyte populations in murine lymphoid tissues. Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology 103, 839-850, doi:10.1002/cyto.a.24788 (2023).
关于Cytek
About Cytek /
Cytek Biosciences, Inc.(Nasdaq: CTKB)作为一家全球技术先的生命科学技术公司,通过其受专利保护的全光谱分析(Full Spectrum Profiling™,FSP™)技术,提供高分辨率、高参数和高灵敏度的新一代细胞分析工具。Cytek的创新技术通过检测荧光信号的完整光谱信息,以实现更高水平更高灵敏度的多参数检测。Cytek的FSP™平台包括其核心仪器 ——Aurora™和Northern Lights™分析系统、Aurora™ CS分选系统,Amnis®和Guava®品牌下的流式细胞仪和成像产品,Cytek Orion™全自动试剂预混系统,增强小颗粒(ESP™)检测技术,以及试剂、软件和服务,为客户提供全面和完整的解决方案。Cytek总部位于美国加利福尼亚州Fremont,在全球设有分部和分销渠道。更多的相关信息,请登录Cytek的官方网站:www.cytekbio.com和www.cytekbio.com.cn。
注:Cytek的产品仅供科研使用,不可用于临床诊断(Cytek® Northern Lights-CLC系统,DxP Athena®系统以及部分试剂除外)。
Cytek, SpectroPanel, Tonbo Biosciences, cFluor, SpectroFlo, ESP, Full Spectrum Profiling, FSP, DxP Athena, Cytek Aurora, Northern Lights, Cytek Orion, Amnis, Guava 和 ImageStream 是Cytek Biosciences, Inc.的商标。
Cytek Biosciences专利包括但不限于:US10739245B2,US11169076B2,US10788411B2,US7320775B2,US7410809B2,US8005314,US8150136,US8817115,US9528989